Kantor Kementerian Agama Kabupaten Wonogiri merupakan instansi vertikal Kementerian Agama Republik Indonesia yang berada di bawah dan bertanggung jawab kepada Kantor Wilayah Kementerian Agama Provinsi Jawa Tengah. Kantor Kementerian Agama Kabupaten Wonogiri bertugas melaksanakan tugas dan fungsi Kementerian Agama di wilayah Kabupaten Wonogiri sesuai dengan kebijakan Menteri Agama dan Kepala Kantor Wilayah Kementerian Agama Provinsi Jawa Tengah. Instansi ini berperan dalam memberikan pelayanan, pembinaan, dan bimbingan di bidang kehidupan beragama, pendidikan keagamaan, serta penyelenggaraan urusan keagamaan bagi seluruh masyarakat.

Dalam melaksanakan tugasnya, Kantor Kementerian Agama Kabupaten Wonogiri menyelenggarakan berbagai layanan, antara lain pelayanan dan pembinaan pendidikan madrasah, pendidikan agama dan keagamaan, bimbingan masyarakat Islam, penyelenggaraan ibadah haji dan umrah, pelayanan zakat dan wakaf, pembinaan pondok pesantren, pelayanan Kantor Urusan Agama (KUA), pembinaan kerukunan umat beragama, serta penguatan moderasi beragama. Selain itu, Kementerian Agama Kabupaten Wonogiri juga terus mengembangkan pelayanan publik berbasis digital melalui berbagai aplikasi layanan keagamaan guna mewujudkan pelayanan yang profesional, transparan, mudah diakses, dan berintegritas. Dengan semangat pelayanan prima, Kantor Kementerian Agama Kabupaten Wonogiri berkomitmen mewujudkan masyarakat yang religius, rukun, moderat, dan harmonis sebagai bagian dari pembangunan daerah dan nasional.